中国科学院拥有140个科研机构和分院，其中一些最著名的研究机构包括中科院物理所、中国科学院微生物研究所、中科院计算机研究所、中科院海洋研究所和中国科学院软件研究所。这些研究所的具体名称如下：
1. 中科院数学与系统科学研究院
2. 中国科学院理论物理研究所
3. 中国科学院自然科学史研究所
4. 中国科学院上海生理研究所
5. 中国科学院西北高原生物研究所
6. 中国科学院感光化学研究所
7. 中国科学院成都山地灾害与环境研究所
8. 中国科学院动物研究所
9. 中国科学院植物研究所
10. 中国科学院上海药物研究所
11. 中国科学院上海昆虫研究所
12. 中国科学院长春应用化学研究所
13. 中国科学院上海冶金研究所
14. 中国科学院上海光学精密机械研究所
15. 中国科学院兰州高原大气物理研究所
16. 中国科学院测量与地球物理研究所
17. 中国科学院武汉病毒研究所
18. 中国科学院遗传研究所
19. 中国科学院广州化学研究所
20. 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所
21. 中国科学院电子学研究所
22. 中国科学院上海原子核研究所
23. 中国科学院固体物理研究所
24. 中国科学院成都生物研究所
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25. 中国科学院武汉岩土力学研究所
26. 中国科学院沈阳应用生态研究所
27. 中国科学院软件研究所
28. 中国科学院青海盐湖研究所
29. 中国科学院电工研究所
30. 中国科学院贵阳地球化学研究所
31. 中国科学院遥感应用研究所
32. 中国科学院地球物理研究所
33. 中国科学院广州电子研究所
34. 中国科学院声学研究所
35. 中国科学院高能物理研究所
36. 中国科学院半导体研究所
37. 中国科学院光电技术研究所
38. 中国科学院武汉物理与数学研究所
39. 中国科学院自动化研究所
40. 中国科学院科技政策与管理科学研究所
41. 中国科学院金属腐蚀与防护研究所
42. 中国科学院新疆地理研究所
43. 中国科学院黑龙江农业现代化研究所
44. 中国科学院化学研究所
45. 中国科学院昆明动物研究所
46. 中国科学院成都计算机应用研究所
47. 中国科学院工程热物理研究所
48. 中国科学院长春地理研究所
49. 中国科学院上海生物化学研究所
50. 中国科学院上海细胞生物学研究所
51. 中国科学院石家庄农业现代化研究所
52. 中国科学院上海脑研究所
53. 中国科学院微生物研究所
54. 中国科学院生物物理研究所
55. 中国科学院沈阳自动化研究所
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